中澳环境发展伙伴项目的五个澳方合作伙伴，分别为：澳大利亚水委员会、澳大利亚农、林与渔业部、澳大利亚可持续性、环境、水、人口和社区部、澳大利亚墨累-达令河流域管理局以及联邦科学与工业研究组织。澳大利亚气候变化与能效部之后作为观察员加入。
澳大利亚水委员会是澳大利亚国家水行动计划中，负责推动水改革的牵头单位，为澳大利亚的水资源管理进行规划。
• NWC - Jun 11 
澳大利亚可持续性、环境、水、人口和社区部：原名澳大利亚环境、水、遗产和艺术部，负责立法、制定国家政策和执行相关项目以保护澳大利亚的环境和文化遗产，促进澳大利亚的可持续性。
• SEWPaC - Sep 11
澳大利亚农、林、渔业部：负责制定政策和执行相关项目，确保澳大利亚的农业、渔业、食品和林业保持竞争性、赢利性和可持续性。
• DAFF - Oct 11
澳大利亚政府墨累-达令河流域管理局：原墨累-达令河流域的官方委员会，负责规划墨累－达令河流域水资源的综合管理。
• MDBA - Oct 11
联邦科学与工业研究组织：是澳大利亚国家级科学研究机构，并且是世界上最大和研究领域最广泛的研究机构之一。
• CSIRO - Sep 11
澳大利亚气候变化与能效部（观察员）：负责在环境保护，发展可持续性社会和经济支持方面的执行。